Akreditasi merupakan salah satu bentuk pengakuan terhadap status sebuah prodi baik itu dari segi kurrikulum, sarana dan kualitas dari semua komponennya (termasuk mahasiswa, dosen, laboran dan tata usaha). Untuk itu ikut serta dalam akreditasi juga dilakukan oleh prodi Biologi UNJA. Setelah mengajukan borang akreditasi pada bulan September 2016 maka tim assesor datang melakukan peninjauan pada tanggal 10 oktober 2016.Tim Assesor untuk prodi biologi adalah Dr Diah Rachmawati (UGM) dan Prof. Hendro Pramono (UNSOED).
